La definición de la botánica no está clara aún, pues es confuso tratar de definir el término planta, por lo que existe controversia al tratar de establecer qué organismos deberían ser estudiados por la botánica

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Ten en cuenta:

Tradicionalmente, los botánicos se encargaban de estudiar los organismos que no parecieran ser animales, así que su objeto de estudio incluía seres tan variados como los hongos, las algas, los mohos mucilaginosos, las bacterias fotosintéticas y las plantas terrestres.

Hoy día se ha establecido que:

1) Las algas son un grupo polifilético de protistas.
2) Los hongos están más cercanamente emparentados con los animales que con las plantas.
3) Las bacterias pertenecen a otro dominio de la vida